昭通卫校创建于1957年，是省部级重点中专，也是全省最早的一所地州级中等卫生学校，至今已有58年办学历史，为滇东北卫生事业培养了2万多名医务人员。截至今年11月，昭通卫校现有在校生4549人，其中中专层次学生2895人，专科层次1654人（与大理大学、云南开放大学、曲靖医专、楚雄医专等联办），另有成人教育3500人，毕业生就业率达95%以上。

2010年2月，昭通市委、市政府作出逐步推进昭通职教中心建设的战略抉择；2013年12月，市委、市政府作出修建昭通卫生职业学院的重大抉择，之后昭通各方努力配合、积极申请。

2015年11月30日，云南省教育厅批准昭通筹建昭通卫生职业学院，明确拟筹建的学校属专科层次的公办高等职业技术学院，筹建期为1年（2015年11月27 日——2016年11月27日），如逾期达不到国家固定的设置标准，未能获得批准正式建校，将自行撤销。

2016年4月，教育部发文，同意昭通卫生职业学院备案